个税补税：选择的两家单位有差异吗？

我个人所得税上面有两家单位，一家是正常上班的（这个有每个月正常扣税），一家是外地的单位（有给我上了三个月的社保，没有交税）。
现在要我补税，我也认可。
我不想现在的单位知道这个事情。
请教选外地的单位可以吗（我已经和这单位结束相关关系）？
不会对以后的正常上班的单位有影响吧？

(1)正常上班的单位一直有正常交社保。外地单位是临时要证明我在他们单位上班，就交了三个月的社保。目前两份社保不打算转移在一起，等到退休时再说吧。
目前情况是社保是可以在不同的地方交，但是相同月份的社保仅仅可以享受一份收益。
例如在A地交了十年社保，你失业了，按规定可以在A地领失业保险，但是如果发现B地有社保，就不能在A地领失业保险了。（社保是联网的了）。
不同的单位在相同月份交的社保可以选择退一份的个人提交的养老保险的个人交的部分，单位交的不退。

（2)外地上保险是按月薪3800上的,当时低于5000就不用管个税，现在社保和个税都是现在在个税抵扣系统，就要把那三个月的个税补交。

现在已经和外地的公司没有关系了。
目前的单位就算知道这个事情也关系不大（这两个公司从事的业务没有了利益冲突，不违反规定）。。
申报时写外地公司也行，就不知道对后面的个税有没有影响。
填写现在的单位，就可能会罗嗦。

和一位类似情形的人事探讨了下，认为补税申报单位应该填产生补税的外地的单位，因为他才产生补税。工作单位是按规定交税的，产生补税和工作单位没有什么关系，它扣它自己的就行。