请教 pc与plc及触摸屏之间的连接问题

   公司的产品是fx3u控制的设备，触摸屏也是三菱的。今天电脑上修改程序后，要写入plc验证。
   电脑和触摸屏通过网线连接，PLC和触摸屏也已经连接好（之前同事都是这样笔记本插上网线接头，在GX Works2中在线->写入plc，通过触摸屏控制设备看效果）。今天笔记本插入网线连接后，plc 写入 时显示通讯失败。就按“调试”->"模拟开始/停止”，之后用触摸屏控制设备运行，中间设备运行有问题，还改了plc程序，再次“调试”，设备运行问题解决。可是同事说这样其实没有把程序写入plc，所以等于设备运行的程序还是原来plc中的老程序。
   可是明明中间运行出现问题，修改程序之后相应的问题解决，说明机器跑的是电脑上的plc程序吧？我的理解是plc和电脑都是控制器，把程序放到plc上运行，和放到电脑里运行是一样的。只是验证一下修改的程序是否实现相应的功能，一定要把Pc中的程序写入plc，然后再在plc上运行程序才行吗？是我的理解有偏差吗？
   刚入职的小白，很多东西不理解，手册也看不大懂，所以请前辈们多指教，万分感激！